206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3608 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  53.65 
 
 		 594 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.9 
 
 		 591 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.61 
 
 		 592 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.44 
 
 		 592 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.29 
 
 		 594 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 589 aa  1234    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.45 
 
 		 592 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.86 
 
 		 592 aa  705    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.52 
 
 		 593 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.61 
 
 		 592 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.86 
 
 		 591 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.1 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.61 
 
 		 592 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.27 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.27 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.27 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  51.36 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  51.36 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  50.93 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  50.93 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.59 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.93 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  50.42 
 
 		 594 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  50.45 
 
 		 588 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.64 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.53 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  44.41 
 
 		 591 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.48 
 
 		 589 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  45.79 
 
 		 596 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.01 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.75 
 
 		 590 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.99 
 
 		 586 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  41.8 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  41.62 
 
 		 573 aa  465  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.31 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.8 
 
 		 755 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 		 550 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.72 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.3 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.71 
 
 		 522 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.71 
 
 		 522 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.74 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.78 
 
 		 522 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.78 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.86 
 
 		 528 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.95 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.18 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.21 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  28.29 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.94 
 
 		 526 aa  134  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 545 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  24.66 
 
 		 647 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.25 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  23.76 
 
 		 573 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.56 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  24.37 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.44 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 		 579 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.8 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.19 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.55 
 
 		 582 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.16 
 
 		 579 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.31 
 
 		 578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  24.83 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.48 
 
 		 562 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 		 545 aa  107  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.49 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 570 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  24.41 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.66 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  22.95 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 		 534 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.62 
 
 		 570 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 561 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.44 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.84 
 
 		 560 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.37 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  22.5 
 
 		 558 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.66 
 
 		 524 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  23.91 
 
 		 549 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.57 
 
 		 573 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.63 
 
 		 545 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.15 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.31 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 		 518 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>