More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1639 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  100 
 
 		 466 aa  894    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  53.36 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  52.2 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  55.58 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  53.98 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  49.54 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  51.84 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 462 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  35.96 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  33.57 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 454 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  33.17 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  32.01 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 501 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 517 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 515 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 520 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 485 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.02 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 503 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 509 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  27 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.63 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 495 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  25.96 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.47 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.36 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.83 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.59 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>