279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2426 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2426  PKD  100 
 
 
1814 aa  3735    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  45.52 
 
 
2176 aa  1106    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.19 
 
 
1667 aa  355  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.7 
 
 
1094 aa  350  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.18 
 
 
2272 aa  320  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  33.58 
 
 
1862 aa  309  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.26 
 
 
1361 aa  303  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.61 
 
 
1667 aa  296  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.97 
 
 
1682 aa  283  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.02 
 
 
1387 aa  281  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.47 
 
 
963 aa  266  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.11 
 
 
1528 aa  258  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.97 
 
 
941 aa  242  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.93 
 
 
1236 aa  238  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.55 
 
 
1606 aa  235  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.53 
 
 
1282 aa  234  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  30.57 
 
 
1783 aa  233  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.52 
 
 
561 aa  229  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  35.17 
 
 
978 aa  228  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40.79 
 
 
1356 aa  227  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.93 
 
 
1842 aa  226  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.21 
 
 
2554 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  36.49 
 
 
752 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.9 
 
 
735 aa  210  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  36.53 
 
 
575 aa  206  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  39.07 
 
 
1024 aa  205  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  37.53 
 
 
2036 aa  205  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.07 
 
 
1882 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.01 
 
 
528 aa  202  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.08 
 
 
838 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.16 
 
 
2122 aa  195  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  37.74 
 
 
530 aa  195  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.17 
 
 
859 aa  194  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  37.41 
 
 
2000 aa  192  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.24 
 
 
1602 aa  191  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.03 
 
 
1620 aa  189  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  27.32 
 
 
1011 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.57 
 
 
1300 aa  180  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.39 
 
 
861 aa  179  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.08 
 
 
675 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.67 
 
 
679 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  26.9 
 
 
952 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  38.49 
 
 
669 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  38.41 
 
 
1120 aa  173  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  36.05 
 
 
713 aa  172  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.59 
 
 
685 aa  172  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.8 
 
 
1241 aa  171  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.41 
 
 
1969 aa  171  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.61 
 
 
958 aa  169  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36.75 
 
 
658 aa  169  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.65 
 
 
930 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  36.83 
 
 
460 aa  166  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
3295 aa  164  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 
1732 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  35.79 
 
 
551 aa  155  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.05 
 
 
910 aa  153  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  39 
 
 
547 aa  152  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.06 
 
 
869 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.02 
 
 
615 aa  146  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.89 
 
 
581 aa  145  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.78 
 
 
1371 aa  143  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  41.49 
 
 
646 aa  143  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  43.72 
 
 
1189 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  35.02 
 
 
791 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.52 
 
 
971 aa  139  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28 
 
 
734 aa  138  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  26.3 
 
 
865 aa  138  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.41 
 
 
929 aa  132  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.23 
 
 
1565 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  27.91 
 
 
1314 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.71 
 
 
1095 aa  130  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.23 
 
 
1292 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30.62 
 
 
1531 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  31.55 
 
 
443 aa  120  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.71 
 
 
1389 aa  120  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.3 
 
 
1466 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  29.3 
 
 
719 aa  119  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.99 
 
 
644 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.61 
 
 
519 aa  116  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  36 
 
 
560 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  27.71 
 
 
823 aa  112  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.48 
 
 
786 aa  111  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  34.3 
 
 
870 aa  111  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 
845 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  42.68 
 
 
873 aa  111  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.03 
 
 
439 aa  110  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  34.58 
 
 
2552 aa  109  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.25 
 
 
184 aa  108  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  28.49 
 
 
802 aa  108  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  33.2 
 
 
1162 aa  108  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  28.21 
 
 
517 aa  107  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.42 
 
 
500 aa  106  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.9 
 
 
930 aa  105  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.34 
 
 
840 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.55 
 
 
1482 aa  102  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.57 
 
 
1230 aa  102  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  24.26 
 
 
1057 aa  102  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.21 
 
 
1987 aa  102  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  34.91 
 
 
819 aa  99  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.04 
 
 
777 aa  97.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>