250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0756 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  32.45 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.86 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  40.82 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  35.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  42.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  38 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  44.23 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 357 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  36.73 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.29 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.29 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  45.83 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>