More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2894 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
421 aa  861    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.01 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  26.56 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
411 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.76 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 
415 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
452 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3458  Extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
401 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
415 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
415 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
390 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
419 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1581  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
401 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
384 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  24.21 
 
 
451 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  25.07 
 
 
407 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.07 
 
 
407 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.07 
 
 
402 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.29 
 
 
401 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
414 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
390 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
400 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
396 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0349  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
407 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
395 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
410 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1749  ABC transporter substrate-binding protein  26.3 
 
 
442 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239653  normal  0.31899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.29 
 
 
399 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
399 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 
397 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
396 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  22.84 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.29 
 
 
392 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.17 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.17 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0619  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.17 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  23.84 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  23.76 
 
 
450 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.95 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2759  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 
450 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
406 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3718  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.18 
 
 
450 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1944  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
416 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
450 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.14 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  22.6 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  24.11 
 
 
417 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
401 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.97 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
390 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.3 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  26.85 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 
389 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1752  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein  25.25 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.56 
 
 
396 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
389 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  21.61 
 
 
389 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  23.03 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.33 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.33 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.25 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.6 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  27.64 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1560  urea ABC transporter, substrate-binding protein  27.58 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  24.02 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  26.08 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  26.53 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4272  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844691  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.08 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  22.37 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.26 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  23.78 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>