More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0349 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0349  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
407 aa  840    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  56.43 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  41.75 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  41.94 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  39.23 
 
 
412 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.836908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3020  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  39.83 
 
 
412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4292  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  38.59 
 
 
412 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3322  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  39.36 
 
 
415 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2663  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  38.66 
 
 
412 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1560  urea ABC transporter, substrate-binding protein  36.93 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
387 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 
389 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  32.78 
 
 
386 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 
421 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  31.93 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  33.08 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 
393 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6254  putative urea/short-chain binding protein  29.05 
 
 
369 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.16 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
384 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 
419 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
438 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  31.7 
 
 
419 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  32.38 
 
 
417 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  31.64 
 
 
443 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3980  histidine kinase  29.84 
 
 
659 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
382 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 
418 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  31.61 
 
 
418 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
421 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
421 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  32.11 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  31.35 
 
 
418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1045  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 
420 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  32.84 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  32.72 
 
 
405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
384 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0942  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3001  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.13 
 
 
433 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
419 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1289  putative substrate-binding component of ABC transporter  29.76 
 
 
436 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  32.39 
 
 
435 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  32.04 
 
 
422 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  32.38 
 
 
423 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3702  branched-chain amino acid uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  31.02 
 
 
439 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.22 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.51 
 
 
425 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  32.39 
 
 
435 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  32.39 
 
 
435 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  31.77 
 
 
418 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  32.9 
 
 
435 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.82 
 
 
435 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2620  putative UreA short-chain amide  30.6 
 
 
428 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0882904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4229  hypothetical protein  32.35 
 
 
426 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.527328  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 
420 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  31.72 
 
 
422 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1953  putative aliphatic amidase expression-regulating protein (amiC)  30.3 
 
 
410 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1506  putative substrate-binding component of ABC transporter  30.06 
 
 
436 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2996  putative amidase expression-regulating protein  32.27 
 
 
391 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3638  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.68 
 
 
382 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13399  normal  0.0727576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.65 
 
 
435 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  31.17 
 
 
423 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  32.65 
 
 
435 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7018  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  31.16 
 
 
440 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0948  branched-chain amino acid ABC transporter, putative  30.5 
 
 
427 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 
427 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  31.69 
 
 
421 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4605  urea ABC transporter, urea binding protein  30.4 
 
 
430 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0446253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4149  putative urea short-chain amide or branched-chain amino acid uptake ABC transporter  30.7 
 
 
434 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  30.03 
 
 
440 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0188  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.21 
 
 
444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2794  urea ABC transporter, urea binding protein  31.48 
 
 
422 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 
420 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1340  urea ABC transporter urea binding protein  31.48 
 
 
422 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.231626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2873  urea ABC transporter, urea binding protein  31.48 
 
 
422 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3510  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 
440 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118582  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  30.36 
 
 
428 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0954  urea ABC transporter, urea binding protein  30.83 
 
 
431 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4191  urea ABC transporter, urea binding protein  30.48 
 
 
440 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.55 
 
 
421 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1597  urea ABC transporter, urea binding protein  31.69 
 
 
414 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.948764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  31.62 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  30.81 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00881  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.34 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  31.83 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  31.43 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.33 
 
 
421 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4184  ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  29.91 
 
 
430 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.11561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4885  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.07 
 
 
421 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  30.81 
 
 
421 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3683  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.75 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1305  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.13 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614657  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1202  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  30.48 
 
 
419 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  30.55 
 
 
422 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>