124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6229 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 461 aa  953    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  67.03 
 
 		 673 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  28.51 
 
 		 566 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  30.65 
 
 		 900 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  31.12 
 
 		 584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  56.25 
 
 		 610 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  56.25 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  55.36 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  49.55 
 
 		 1167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  52.25 
 
 		 726 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  49.11 
 
 		 541 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  44.96 
 
 		 884 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  45.13 
 
 		 957 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  47.79 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  46.79 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  46.9 
 
 		 1132 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  28.03 
 
 		 705 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  49.07 
 
 		 1391 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  49.55 
 
 		 383 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  26.65 
 
 		 743 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  40.91 
 
 		 853 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  48.18 
 
 		 982 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 933 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  45.95 
 
 		 918 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  26.54 
 
 		 681 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  41.82 
 
 		 869 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  28.14 
 
 		 545 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1024 aa  87  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  28.44 
 
 		 593 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  41.82 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.98 
 
 		 948 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  44.55 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  38.39 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  26.02 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  39.09 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  26.54 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  25.37 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  40.37 
 
 		 877 aa  73.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.29 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.93 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.45 
 
 		 1321 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  39.42 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.09 
 
 		 1338 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 1356 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  42.11 
 
 		 1707 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.42 
 
 		 802 aa  70.1  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.6 
 
 		 870 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  25.97 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  23.53 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 845 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  23.79 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.81 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.6 
 
 		 823 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 502 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  39.22 
 
 		 1380 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 1004 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.67 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.61 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.45 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 840 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  20.18 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  23.71 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.5 
 
 		 1295 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.89 
 
 		 2554 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  25.99 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  36 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  21.82 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  45.68 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  29.68 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 3295 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 1732 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.04 
 
 		 1444 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32 
 
 		 972 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  32.63 
 
 		 1799 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  31.73 
 
 		 1091 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 735 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  40.28 
 
 		 524 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  32.73 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  39.76 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  31.43 
 
 		 966 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  39.36 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.93 
 
 		 930 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.99 
 
 		 1234 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  36.28 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  27.34 
 
 		 581 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  32.73 
 
 		 551 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  25 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.53 
 
 		 954 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.87 
 
 		 1035 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  31.93 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  23.64 
 
 		 601 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>