More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5445 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  100 
 
 		 1161 aa  2208    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  38.14 
 
 		 1123 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.99 
 
 		 1123 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  34.83 
 
 		 1114 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  42.45 
 
 		 1121 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.21 
 
 		 1150 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  33.28 
 
 		 1090 aa  347  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  42.16 
 
 		 1118 aa  330  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  36.62 
 
 		 1132 aa  299  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 1141 aa  290  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 1036 aa  275  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 1148 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 1118 aa  264  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 1141 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1141 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1141 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 723 aa  244  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.77 
 
 		 1071 aa  241  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 1198 aa  238  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.31 
 
 		 969 aa  221  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  49 
 
 		 489 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.9 
 
 		 1146 aa  192  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.04 
 
 		 1000 aa  191  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  41.35 
 
 		 1733 aa  191  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  39.45 
 
 		 1699 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1151 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  49.19 
 
 		 655 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 940 aa  174  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  42.59 
 
 		 1013 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 268 aa  172  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 981 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  41.81 
 
 		 1102 aa  171  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.35 
 
 		 1092 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.67 
 
 		 1010 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.87 
 
 		 1017 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 950 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  42.26 
 
 		 1088 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.76 
 
 		 1005 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  42.26 
 
 		 647 aa  166  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  48.77 
 
 		 676 aa  165  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 		 1158 aa  165  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 957 aa  164  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 965 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 968 aa  162  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.44 
 
 		 1003 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 1193 aa  161  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 1030 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 622 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  43.36 
 
 		 378 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 621 aa  158  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 1022 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.22 
 
 		 960 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 934 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 1022 aa  157  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 1100 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 943 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 1108 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 628 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40.29 
 
 		 926 aa  154  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  40.73 
 
 		 388 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.26 
 
 		 1339 aa  154  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 1071 aa  153  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 1190 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 1058 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 1048 aa  152  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  42.51 
 
 		 611 aa  151  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 952 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.24 
 
 		 1018 aa  149  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 267 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  32.25 
 
 		 1034 aa  148  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 979 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 1029 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.53 
 
 		 921 aa  147  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 833 aa  146  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.59 
 
 		 1055 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  38.22 
 
 		 278 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 992 aa  145  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 1097 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.2 
 
 		 919 aa  144  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 453 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  45.38 
 
 		 1048 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.8 
 
 		 496 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 1028 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  39.93 
 
 		 262 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.44 
 
 		 631 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.31 
 
 		 1110 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 1186 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1093 aa  140  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  40.07 
 
 		 1004 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 1227 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 297 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 1011 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 983 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.31 
 
 		 1103 aa  137  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  39.53 
 
 		 915 aa  135  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 993 aa  135  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 921 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 		 962 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.53 
 
 		 621 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>