193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2367 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 767 aa  1582    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 797 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 771 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 779 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  31.53 
 
 		 791 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 800 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  30.51 
 
 		 822 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 777 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 753 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 772 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 875 aa  97.8  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 772 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 806 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.05 
 
 		 859 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 792 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  27.74 
 
 		 800 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  20.86 
 
 		 793 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 814 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 787 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1089 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 775 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 804 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 935 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 874 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 923 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 897 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  21.07 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 792 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.32 
 
 		 906 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1109 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.73 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  20.72 
 
 		 917 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 923 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 902 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 962 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1126 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 962 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25 
 
 		 1122 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 933 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25 
 
 		 1120 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 1114 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  27.55 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 998 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 931 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  27.52 
 
 		 1125 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1036 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  23.75 
 
 		 821 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 816 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.72 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 793 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  21.72 
 
 		 928 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 1087 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.32 
 
 		 827 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 789 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 957 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 813 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 952 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 776 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 866 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  27.36 
 
 		 865 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  40.79 
 
 		 1182 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1066 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 815 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1051 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1001 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 749 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 966 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 938 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 1041 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 812 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 760 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  38.67 
 
 		 381 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1023 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 791 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 991 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 1105 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 804 aa  50.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  21.45 
 
 		 821 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 933 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 993 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 824 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 793 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>