More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2273 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  39.94 
 
 		 992 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 994 aa  2009    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1086 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1006 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 982 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 989 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1161 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1027 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 1043 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 986 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 999 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  33.37 
 
 		 925 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1150 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1028 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1155 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1010 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1181 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1051 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1158 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1120 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1012 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 997 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1173 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1037 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1137 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1114 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1071 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1039 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1014 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1006 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1062 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.24 
 
 		 1019 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1140 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1163 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1119 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1128 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1155 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1079 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1177 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1064 aa  370  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1071 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1122 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1028 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1008 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1000 aa  364  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1026 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1152 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1003 aa  361  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1148 aa  360  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.01 
 
 		 1024 aa  360  6e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1075 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1117 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1024 aa  359  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 996 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1023 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 994 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1164 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1028 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 1063 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1080 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1130 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 1041 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1096 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1066 aa  354  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.73 
 
 		 1023 aa  353  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1013 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1132 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1018 aa  352  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1124 aa  350  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 1041 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1116 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1019 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1047 aa  347  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1096 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1038 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1053 aa  347  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1129 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1154 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1177 aa  344  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1017 aa  343  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1060 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1081 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1029 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1076 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1113 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 993 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1077 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1040 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1102 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 1035 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1062 aa  333  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1063 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 979 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1031 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1146 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1160 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1103 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>