283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1439 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 527 aa  1092    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  49.72 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  46.27 
 
 		 537 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  35.66 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  35.85 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  32.57 
 
 		 539 aa  239  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  32.38 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  32.04 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 		 537 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 529 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  30.26 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  28.94 
 
 		 519 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.58 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 562 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  32.58 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 530 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  24.27 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.05 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 555 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  28.6 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 497 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 508 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.45 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.91 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 488 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 564 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 533 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 582 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 549 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 503 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 503 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.36 
 
 		 476 aa  94  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 557 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 549 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.85 
 
 		 507 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.67 
 
 		 532 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 514 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 506 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 503 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 557 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 507 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.11 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>