138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1130 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.396679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  34.02 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  32.07 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1128  hypothetical protein  30.22 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.499408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1111  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0805957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3674  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1946  hypothetical protein  35.82 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1098 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1128 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1051 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1165 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1071 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 1050 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1079 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 		 1188 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  37.36 
 
 		 1138 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 999 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1060 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1186 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 1016 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 874 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1119 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1116 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1155 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1062 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1155 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 1142 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  37.63 
 
 		 1173 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  36.23 
 
 		 1237 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1045 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1023 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1097 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1075 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 760 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1161 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1006 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  32.74 
 
 		 1051 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1102 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1177 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1122 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  36.44 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1154 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1016 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 1043 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1029 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  37.35 
 
 		 792 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1105 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1199 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1081 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 1010 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1045 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1148 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 1086 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1095 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1152 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1154 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1117 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 1001 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1006 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 996 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1047 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 1144 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1109 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1127 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1059 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1161 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 918 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 1176 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1068 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1177 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  34.48 
 
 		 800 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  38.81 
 
 		 1011 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1059 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1081 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1114 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1161 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 1040 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1096 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1127 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 998 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1093 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  36.99 
 
 		 799 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1106 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1129 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 1065 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1046 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 1176 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 991 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1059 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1144 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1036 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 1063 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 1175 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 946 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1198 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1102 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1042 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1073 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>