290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0226 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 556 aa  1159    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  46.95 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  35.09 
 
 		 594 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  35.17 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  34.67 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  34.49 
 
 		 582 aa  253  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  33.56 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  34.45 
 
 		 592 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 592 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  35.3 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 582 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 592 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  33.5 
 
 		 579 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.2 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.81 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.4 
 
 		 507 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.44 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 556 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.34 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 488 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 531 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 489 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 523 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.5 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 564 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 539 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 548 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 555 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 477 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.96 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 582 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.89 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 600 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 594 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 540 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>