230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  41.2 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 1022 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  40.39 
 
 		 950 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.2 
 
 		 621 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 654 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  39.6 
 
 		 378 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.63 
 
 		 631 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  41.09 
 
 		 1733 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.49 
 
 		 1000 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 622 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 981 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  37.05 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.43 
 
 		 957 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 1108 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.03 
 
 		 453 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.97 
 
 		 1013 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.3 
 
 		 960 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 1088 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.89 
 
 		 1339 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 934 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.48 
 
 		 921 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 965 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 992 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 1092 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 1071 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 931 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 1003 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 621 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 968 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.9 
 
 		 993 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.6 
 
 		 1110 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 1058 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.6 
 
 		 992 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.8 
 
 		 1020 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 833 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.73 
 
 		 919 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 1004 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.57 
 
 		 1699 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 1003 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 1014 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 989 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 1021 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  39.3 
 
 		 954 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.29 
 
 		 1055 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 1093 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 1025 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.2 
 
 		 1072 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 990 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 981 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.1 
 
 		 1056 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 971 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 990 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  33.2 
 
 		 1048 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 1125 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 983 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 1028 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 921 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.71 
 
 		 496 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 1042 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 1186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.3 
 
 		 1036 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 979 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 		 935 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.1 
 
 		 388 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 1103 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 940 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.98 
 
 		 1017 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 1005 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 1319 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1010 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 760 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.46 
 
 		 1118 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 668 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 969 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1102 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 995 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 1030 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.01 
 
 		 1058 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1033 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 1066 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 941 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.2 
 
 		 1050 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 1030 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.62 
 
 		 1123 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1043 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1025 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 1011 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 1100 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 489 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 964 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 		 1027 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>