173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0256 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 813 aa  1668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 827 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 820 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 847 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 817 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 818 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 805 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 816 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 814 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 705 aa  288  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 805 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 897 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 611 aa  267  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 883 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 808 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 806 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 820 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 725 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 821 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 813 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  27.31 
 
 		 709 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 818 aa  221  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 830 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 794 aa  216  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 805 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 822 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 810 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.77 
 
 		 815 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 817 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 793 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 812 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 799 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 824 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 826 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 812 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 973 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 866 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 934 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 795 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 803 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 853 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 810 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 748 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.82 
 
 		 715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 828 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 852 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.01 
 
 		 894 aa  146  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 832 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 869 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 705 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 823 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.12 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 791 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 819 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.98 
 
 		 961 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 998 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  28.94 
 
 		 926 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.53 
 
 		 946 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.44 
 
 		 782 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  25.9 
 
 		 930 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  28.91 
 
 		 929 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  27.2 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.2 
 
 		 921 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.11 
 
 		 915 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.05 
 
 		 952 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.59 
 
 		 944 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.65 
 
 		 904 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.02 
 
 		 929 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  24.76 
 
 		 887 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  23.17 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.81 
 
 		 965 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1089 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.29 
 
 		 1195 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3125  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 785 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1149 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.79 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  21.52 
 
 		 920 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1102 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  23.4 
 
 		 895 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 792 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 748 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 935 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1103 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 783 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 817 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25 
 
 		 908 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 946 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 775 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 943 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 936 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>