More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1899 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  941    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
492 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
505 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
510 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
991 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
834 aa  206  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  43.75 
 
 
1182 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  53.44 
 
 
204 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  41.61 
 
 
892 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  42.69 
 
 
754 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
572 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  40.7 
 
 
682 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  35.31 
 
 
886 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
526 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
488 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  46.12 
 
 
945 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
1654 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
727 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  40.29 
 
 
449 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  36.42 
 
 
1210 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.26 
 
 
1239 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.08 
 
 
783 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  38.44 
 
 
918 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  39.26 
 
 
704 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  44.78 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  40.96 
 
 
1047 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  37.82 
 
 
657 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
815 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  40.81 
 
 
1248 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  32.48 
 
 
800 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.6 
 
 
746 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  40.16 
 
 
936 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.85 
 
 
744 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
964 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
524 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  40.96 
 
 
819 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
3706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
1253 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
1714 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  58.91 
 
 
302 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
1246 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
547 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
681 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
980 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  34.83 
 
 
676 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  38.26 
 
 
1289 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
1093 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  55.07 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.25 
 
 
1668 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
1093 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
945 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
631 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
771 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.44 
 
 
1663 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
439 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
909 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
613 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
767 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
215 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
839 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
723 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
1560 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
764 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
1390 aa  147  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
872 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
382 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
1177 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  58.06 
 
 
457 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  58.06 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
2693 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  58.06 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
782 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
878 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
941 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.34 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  54.03 
 
 
457 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  54.84 
 
 
457 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
732 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.42 
 
 
454 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
774 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  54.84 
 
 
457 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
788 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.63 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  54.03 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  54.84 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  54.84 
 
 
457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  54.03 
 
 
461 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  54.03 
 
 
456 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  54.55 
 
 
466 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  54.62 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
732 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  50.72 
 
 
457 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
603 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.72 
 
 
457 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
813 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
1051 aa  133  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>