More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0825 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  100 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  55.9 
 
 		 492 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 		 462 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 510 aa  174  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 505 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  55.86 
 
 		 302 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  49.12 
 
 		 285 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.95 
 
 		 454 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  48.55 
 
 		 151 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  49.25 
 
 		 457 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  48.89 
 
 		 457 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  49.25 
 
 		 457 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  47.76 
 
 		 455 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  44.51 
 
 		 457 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  43.9 
 
 		 457 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  44.51 
 
 		 457 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.51 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.41 
 
 		 457 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  44.72 
 
 		 466 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  43.9 
 
 		 457 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  43.29 
 
 		 457 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  44.44 
 
 		 454 aa  127  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  44.37 
 
 		 460 aa  125  6e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 		 373 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 469 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  46.83 
 
 		 456 aa  121  7e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1136  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.59 
 
 		 348 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 503 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  46.62 
 
 		 403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  44.53 
 
 		 458 aa  119  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  44.53 
 
 		 458 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  39.2 
 
 		 414 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  48.39 
 
 		 461 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  33.52 
 
 		 513 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  48.39 
 
 		 456 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  49.6 
 
 		 461 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.93 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 376 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.85 
 
 		 435 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.02 
 
 		 705 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 457 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 566 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  43.41 
 
 		 382 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 301 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.41 
 
 		 457 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 457 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  47.46 
 
 		 462 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 457 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.05 
 
 		 844 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1431 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.07 
 
 		 705 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 846 aa  111  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  41.67 
 
 		 383 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.37 
 
 		 312 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 377 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 369 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.57 
 
 		 457 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.75 
 
 		 331 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 377 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.73 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  41.73 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 		 427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.34 
 
 		 370 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  47.24 
 
 		 457 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 383 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 383 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.64 
 
 		 457 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  43.85 
 
 		 1376 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.41 
 
 		 457 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 		 619 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 		 367 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 386 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 373 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  42.15 
 
 		 337 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 386 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.53 
 
 		 1177 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  43.31 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  41.8 
 
 		 1111 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 406 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.48 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 339 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.65 
 
 		 464 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  41.09 
 
 		 969 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  36.89 
 
 		 1127 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 480 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 353 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>