More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1227 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  100 
 
 		 424 aa  859    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  54.24 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  43.14 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  42.64 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  33.99 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  33.33 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  28.24 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  31.54 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  33.73 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  27.39 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  27.73 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.59 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  26.86 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  27.08 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  30.38 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  29.46 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  29.71 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.73 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  27.65 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  26.41 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.32 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.4 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  27.78 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  27.9 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  27.33 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  27.77 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  26.21 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  29.59 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  26.51 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.36 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  25.23 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.16 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.58 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  25.92 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  28.07 
 
 		 505 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  28.07 
 
 		 505 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.06 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.04 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.09 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  29.23 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  27.76 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  27.76 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  27.76 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  27.51 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  27.19 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.72 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.23 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  44.23 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.1 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.46 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  42.59 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.9 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  43.64 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.47 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.85 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  27.76 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.47 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.65 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.26 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  27.18 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  27.33 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  24.14 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  28.46 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  32.75 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  32.58 
 
 		 181 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 367 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.27 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  23.32 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  21.36 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  34.11 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  31.29 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  32.7 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.1 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  25.6 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  24.68 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>