More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3540 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  100 
 
 
420 aa  868    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  29.45 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.23 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  27.14 
 
 
414 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.59 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  29.34 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.23 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.65 
 
 
425 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.16 
 
 
403 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  27.45 
 
 
409 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.84 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.06 
 
 
402 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  25.94 
 
 
403 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  29.54 
 
 
418 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  29.54 
 
 
418 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.67 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26.25 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26.25 
 
 
400 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  27.03 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.69 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  25.54 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  25.45 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.69 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  28.4 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  25.18 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  25.59 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.52 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.69 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.8 
 
 
404 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.09 
 
 
414 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  26.48 
 
 
393 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.42 
 
 
446 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.57 
 
 
466 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  26.78 
 
 
418 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 
409 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.61 
 
 
393 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.32 
 
 
433 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 
409 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  25.12 
 
 
461 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.34 
 
 
404 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  24.23 
 
 
394 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  27.31 
 
 
418 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  23.16 
 
 
453 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.23 
 
 
426 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.23 
 
 
418 aa  104  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  25.71 
 
 
455 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  25.54 
 
 
406 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.23 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.51 
 
 
410 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  25.06 
 
 
434 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.73 
 
 
427 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.66 
 
 
449 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25.06 
 
 
404 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  25.25 
 
 
399 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.96 
 
 
401 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  25 
 
 
452 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  25.96 
 
 
401 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  23.99 
 
 
420 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.18 
 
 
409 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  26.51 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  23.06 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.43 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.7 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.55 
 
 
420 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  26.08 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  24.5 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.88 
 
 
415 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  26.54 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  24.63 
 
 
439 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  25.12 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  23.8 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  23.1 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.61 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  24.36 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  22.49 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  23.68 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.58 
 
 
417 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.71 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.4 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  25.06 
 
 
444 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  22.49 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.51 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  23.65 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  23.37 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.82 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  25.92 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.93 
 
 
415 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  25.85 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  26.84 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.27 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.67 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  23.34 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.43 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  23.74 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  24.1 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  23.13 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  22.63 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>