More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0306 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  100 
 
 		 417 aa  847    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  70.44 
 
 		 159 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  35.1 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  36.74 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  35.8 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  32.37 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  33.49 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  31.78 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  32.25 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  31.03 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  33.66 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  30.02 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  31.44 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  33.5 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  29.13 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 444 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  28.64 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  30.52 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.65 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  32.45 
 
 		 361 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  29.06 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  23.76 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.66 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.16 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.58 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26.98 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.65 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  27.08 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.92 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.88 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.06 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.72 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.89 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  27.74 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.48 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.59 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.63 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.5 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.88 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.01 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.6 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.13 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  21.46 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  26.49 
 
 		 452 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  28.71 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  26.07 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  24.63 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  24.63 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  24.82 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.33 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  29.97 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  26.52 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.65 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.47 
 
 		 451 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  27.46 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.19 
 
 		 409 aa  93.2  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.64 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  24.54 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.77 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.53 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  24.63 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.59 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  24.82 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.65 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  22.3 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  27.78 
 
 		 481 aa  86.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.07 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  23.72 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.23 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  25.91 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.59 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  24.07 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  24.65 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  23.97 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.69 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>