More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2964 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  100 
 
 
387 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  34.4 
 
 
448 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  39.47 
 
 
412 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  34.38 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.62 
 
 
393 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  30.31 
 
 
443 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.54 
 
 
397 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.38 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.6 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.11 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  28.54 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.73 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.33 
 
 
463 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.85 
 
 
402 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.13 
 
 
414 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.95 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  28.5 
 
 
423 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  31.89 
 
 
412 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  28.57 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.62 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.17 
 
 
399 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.62 
 
 
413 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.74 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.8 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.15 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.39 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.99 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.76 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.84 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.96 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.78 
 
 
425 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26.15 
 
 
400 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26.15 
 
 
400 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  28.18 
 
 
400 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.99 
 
 
420 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.94 
 
 
379 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.99 
 
 
400 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.58 
 
 
401 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.22 
 
 
399 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  28.5 
 
 
430 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.65 
 
 
415 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.65 
 
 
415 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.65 
 
 
399 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  27.88 
 
 
401 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  27.88 
 
 
401 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.39 
 
 
399 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  29.17 
 
 
404 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.65 
 
 
412 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  25.6 
 
 
476 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  27.23 
 
 
457 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  27.23 
 
 
457 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.28 
 
 
413 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  29.84 
 
 
284 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.6 
 
 
422 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.11 
 
 
337 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.14 
 
 
251 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25.07 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.3 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.98 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  24.83 
 
 
441 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.67 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.7 
 
 
361 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.81 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.55 
 
 
404 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.45 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.54 
 
 
337 aa  92.8  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  25.83 
 
 
422 aa  92.8  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.51 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.96 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.72 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.67 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.7 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 
409 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.91 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.58 
 
 
424 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  23.84 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.5 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.5 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.87 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.8 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.15 
 
 
486 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  26.68 
 
 
472 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  24.45 
 
 
500 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.74 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 
376 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.67 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.67 
 
 
418 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.5 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.69 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  28.01 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.53 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.92 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.16 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  23.47 
 
 
451 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.97 
 
 
451 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.3 
 
 
412 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.8 
 
 
452 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  28.02 
 
 
451 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>