More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1428 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  100 
 
 		 421 aa  854    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  47.67 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  42.76 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  43.38 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  36.85 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  31.05 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  56.76 
 
 		 188 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  30.09 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.47 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  33.73 
 
 		 251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  45.7 
 
 		 159 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.97 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  42.59 
 
 		 172 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.33 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.27 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  30.77 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  31.84 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.51 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.5 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.64 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.59 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.61 
 
 		 396 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.53 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  36.71 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.34 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.66 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.66 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.05 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  28.29 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.98 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.9 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  29.25 
 
 		 387 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.92 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  30 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.77 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30.16 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25.98 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  29.21 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.67 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  27.72 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  28 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.4 
 
 		 354 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  28 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  27.39 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  37.09 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.69 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  30.63 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.71 
 
 		 277 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  25.85 
 
 		 336 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.24 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.81 
 
 		 294 aa  87  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.62 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.2 
 
 		 338 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  29.83 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.33 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  22.35 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.52 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.34 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  26.49 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  26.58 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.24 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  25.9 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  35.63 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.7 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  34.27 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.16 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.8 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  25 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.13 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.74 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  51.32 
 
 		 99 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  27.42 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>