More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5364 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  100 
 
 		 332 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  46.45 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  46.84 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  44.74 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  45.45 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  44.79 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  46.04 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  42.69 
 
 		 343 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  43.27 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  42.98 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  42.73 
 
 		 341 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  42.4 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  42.73 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  43.11 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  41.19 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  42.22 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  40.97 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  43.44 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  38.33 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  38.11 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  39.16 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  38.66 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  38.27 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  42.51 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  47.79 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  37.1 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  36.89 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  37.39 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  34.65 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  35.67 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  33.53 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  34.85 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  54.6 
 
 		 191 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  51.69 
 
 		 121 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  62.22 
 
 		 164 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  38.51 
 
 		 172 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  52.68 
 
 		 126 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.8 
 
 		 251 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.53 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  34.22 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  34.22 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.9 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.83 
 
 		 421 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  30 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.44 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  33.53 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.7 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  28.77 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.11 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.58 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.71 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.24 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.82 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.24 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.57 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  25.64 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  29.29 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.49 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.51 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.85 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  28.51 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  27.6 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  48.57 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.82 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.19 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  22.04 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.42 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.02 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.68 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.57 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  29.06 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  26.42 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  25.71 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.48 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  28.9 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.95 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  26.14 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.82 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>