More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1037 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  100 
 
 		 338 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  47.59 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  44.15 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  44.15 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  44.15 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  44.15 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  42.66 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  50.92 
 
 		 276 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  43.07 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  40.91 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  37.67 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  39.03 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  35.95 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  37.3 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  36.1 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  37.07 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  37.07 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  34.84 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  42.17 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  30.33 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  29.36 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.74 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.74 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  25.75 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  26.22 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.35 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  28.98 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  30.89 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  60.49 
 
 		 122 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.8 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  24.8 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.88 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.2 
 
 		 421 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.2 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  29.62 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.3 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  30.11 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  25.59 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.71 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  30.04 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  31.27 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  27.74 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  25.59 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  34.39 
 
 		 172 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.82 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.78 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  34.19 
 
 		 159 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.94 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  38 
 
 		 188 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  29.44 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  29.64 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.34 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  27.69 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  23.66 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.52 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  30.39 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  25.82 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  29.48 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  27.87 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  27.94 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.85 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.94 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.89 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.42 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  46.25 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.36 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  46.25 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  48.68 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  30.98 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.34 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  26.82 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  21.53 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  28.01 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  26.58 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  28.57 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.15 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  29.39 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.86 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  27.71 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  26.24 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.05 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  25.87 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  32.48 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.68 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>