More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3986 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 172 aa  349  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  83.02 
 
 		 159 aa  274  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  97.47 
 
 		 99 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  45.86 
 
 		 367 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  43.23 
 
 		 404 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  45.22 
 
 		 429 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  44.65 
 
 		 402 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  42.59 
 
 		 421 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  38.65 
 
 		 387 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  41.46 
 
 		 412 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  38.65 
 
 		 387 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  36.69 
 
 		 387 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  43.42 
 
 		 353 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  37.28 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  43.02 
 
 		 378 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  37.01 
 
 		 401 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  40.74 
 
 		 387 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  41.52 
 
 		 275 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  41.1 
 
 		 276 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  40.67 
 
 		 354 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  40.67 
 
 		 354 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  37.58 
 
 		 386 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  38.79 
 
 		 349 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  41.1 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  36.63 
 
 		 387 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  35.58 
 
 		 324 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  36.69 
 
 		 387 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  36.81 
 
 		 334 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  36.47 
 
 		 384 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  39.49 
 
 		 251 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  39.19 
 
 		 384 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  39.13 
 
 		 369 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.92 
 
 		 334 aa  94.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  39.13 
 
 		 369 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  39.13 
 
 		 369 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  39.13 
 
 		 369 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  40.43 
 
 		 384 aa  94.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 513 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  38.61 
 
 		 354 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  35 
 
 		 369 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  39.19 
 
 		 359 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 393 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  35.22 
 
 		 379 aa  91.3  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  34.42 
 
 		 388 aa  90.5  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  32.48 
 
 		 341 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  36.05 
 
 		 337 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  34.39 
 
 		 338 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32.9 
 
 		 400 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.72 
 
 		 390 aa  85.1  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  38.93 
 
 		 482 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.13 
 
 		 444 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 329 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  36.81 
 
 		 377 aa  84.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  40 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  36.02 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  34.59 
 
 		 425 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  34.01 
 
 		 412 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  35.06 
 
 		 434 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  38.19 
 
 		 398 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  32.28 
 
 		 386 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  35.1 
 
 		 397 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  35.62 
 
 		 411 aa  80.9  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  34.91 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  33.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  36.31 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.75 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  36.31 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  36.31 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  34.64 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  35.81 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  32.94 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  32.94 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  30 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.06 
 
 		 369 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  34.18 
 
 		 397 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.66 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 331 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  33.12 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  34.62 
 
 		 340 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  35.67 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  32.68 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.91 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  28.75 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.94 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  35.92 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 451 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  35.17 
 
 		 415 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  31.52 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  32.91 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  32.45 
 
 		 456 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.47 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  32.05 
 
 		 347 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  31.87 
 
 		 339 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  31.65 
 
 		 387 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32.19 
 
 		 337 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 451 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  32.5 
 
 		 387 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>