More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0419 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  100 
 
 
414 aa  832    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  44.31 
 
 
390 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  43.57 
 
 
400 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  42.17 
 
 
392 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  41.37 
 
 
363 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  44.3 
 
 
325 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  46.96 
 
 
305 aa  255  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  39.47 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  38.69 
 
 
378 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  40.3 
 
 
377 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  34.13 
 
 
391 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  37.6 
 
 
477 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  40.58 
 
 
374 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  40.58 
 
 
374 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  36.61 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  35.98 
 
 
386 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.9 
 
 
369 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  36.84 
 
 
370 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  38.75 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  33.05 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  36.07 
 
 
381 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  36.34 
 
 
426 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  37.61 
 
 
370 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  32.49 
 
 
369 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  38.07 
 
 
368 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  33.25 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  34.53 
 
 
443 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 
435 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  36.98 
 
 
383 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  35.2 
 
 
385 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  36.76 
 
 
379 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  36.76 
 
 
379 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  38.92 
 
 
383 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  33.68 
 
 
463 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.15 
 
 
388 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.74 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  33.42 
 
 
422 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  34.13 
 
 
402 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  32.1 
 
 
389 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  34.88 
 
 
403 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  38.12 
 
 
391 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.3 
 
 
392 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.39 
 
 
416 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  32.5 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  32.19 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  37.09 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  35.65 
 
 
404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  36.36 
 
 
378 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  34.23 
 
 
371 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30.32 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  33.07 
 
 
416 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  31.14 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  30.28 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.94 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  34.47 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.76 
 
 
386 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.47 
 
 
423 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  33.01 
 
 
506 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  33.79 
 
 
409 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  31.99 
 
 
370 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  30.25 
 
 
451 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  35.29 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  28.39 
 
 
507 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  31.3 
 
 
494 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  33.85 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.69 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.69 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.86 
 
 
656 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.89 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  35.96 
 
 
365 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.83 
 
 
367 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.96 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  33.24 
 
 
385 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  36.67 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  34.49 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  36.67 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.57 
 
 
413 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.67 
 
 
376 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  29.43 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  28.76 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  33.07 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.07 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  30.81 
 
 
387 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.12 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.96 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  34.95 
 
 
209 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  30.71 
 
 
380 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.63 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.99 
 
 
443 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 
384 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.85 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  26.1 
 
 
387 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  26.94 
 
 
508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  26.94 
 
 
508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.55 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  30.56 
 
 
368 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  29.36 
 
 
404 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.33 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.11 
 
 
338 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.61 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>