More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03620 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  100 
 
 
391 aa  801    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  40.25 
 
 
400 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  38.38 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  37.47 
 
 
379 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  37.67 
 
 
392 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.13 
 
 
414 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  35.32 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  35.68 
 
 
369 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  35.68 
 
 
369 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.66 
 
 
374 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.66 
 
 
374 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  35.48 
 
 
370 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  37 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.11 
 
 
477 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  36.8 
 
 
370 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.97 
 
 
363 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.32 
 
 
369 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  40.2 
 
 
325 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.51 
 
 
377 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  36.29 
 
 
388 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  36.05 
 
 
383 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.16 
 
 
387 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  38.05 
 
 
305 aa  205  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  36.81 
 
 
381 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  35.34 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.46 
 
 
385 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.24 
 
 
379 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.24 
 
 
379 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.94 
 
 
386 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  31.35 
 
 
463 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  33.33 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  32.97 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.05 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  31.2 
 
 
374 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.03 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.57 
 
 
431 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.03 
 
 
422 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.36 
 
 
426 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.2 
 
 
416 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.69 
 
 
389 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.97 
 
 
371 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  33.88 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.28 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.05 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.54 
 
 
403 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.57 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.74 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  33.33 
 
 
381 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.25 
 
 
443 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.51 
 
 
422 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.37 
 
 
373 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.5 
 
 
378 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.11 
 
 
376 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.11 
 
 
376 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.38 
 
 
376 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.04 
 
 
391 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  30.77 
 
 
391 aa  149  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.3 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  30.53 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.02 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.53 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  27.6 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.3 
 
 
376 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.14 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.39 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  29.08 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.16 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.93 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.23 
 
 
471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.23 
 
 
471 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  30.72 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.33 
 
 
387 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.41 
 
 
443 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  38.3 
 
 
209 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.12 
 
 
507 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.99 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  25.29 
 
 
656 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.7 
 
 
451 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.78 
 
 
494 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.88 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  24.86 
 
 
393 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.19 
 
 
386 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.2 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.54 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  23.96 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  24.8 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  28 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.04 
 
 
407 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.46 
 
 
308 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.36 
 
 
397 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  27.73 
 
 
492 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.77 
 
 
376 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.79 
 
 
365 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  25.42 
 
 
395 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  26.24 
 
 
460 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  22.63 
 
 
458 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.59 
 
 
404 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.31 
 
 
370 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.67 
 
 
393 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>