More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1029 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  100 
 
 
400 aa  823    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  56.81 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  43.01 
 
 
390 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  43.57 
 
 
414 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  56.42 
 
 
305 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  43.78 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  47.77 
 
 
325 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  40.25 
 
 
391 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  38.3 
 
 
378 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  39.79 
 
 
377 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  37.11 
 
 
477 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  39.48 
 
 
377 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  36.44 
 
 
369 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  36.44 
 
 
369 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  37.43 
 
 
369 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  35.62 
 
 
370 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  37.5 
 
 
363 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  35.54 
 
 
426 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  38.16 
 
 
383 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  36.36 
 
 
385 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  33.25 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  34.38 
 
 
386 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  34.53 
 
 
443 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.51 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.51 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.92 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  35.32 
 
 
374 aa  209  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  35.34 
 
 
370 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.03 
 
 
383 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  33.25 
 
 
416 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  32.82 
 
 
379 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  32.82 
 
 
379 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  34.63 
 
 
391 aa  199  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.7 
 
 
435 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.26 
 
 
431 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  33.51 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.51 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.14 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.58 
 
 
422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.87 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.57 
 
 
406 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  30.59 
 
 
388 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.94 
 
 
378 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.54 
 
 
357 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30.75 
 
 
373 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.93 
 
 
389 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.47 
 
 
404 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.89 
 
 
402 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.52 
 
 
463 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.81 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  27.01 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  32.06 
 
 
423 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  26.61 
 
 
503 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.97 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.16 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.97 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.07 
 
 
381 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.61 
 
 
376 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.07 
 
 
381 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.99 
 
 
376 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.51 
 
 
407 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  28.74 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.38 
 
 
370 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.15 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.43 
 
 
507 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.97 
 
 
391 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.48 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  30.28 
 
 
308 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.3 
 
 
471 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.75 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.3 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.42 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.56 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  26.16 
 
 
445 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  26.16 
 
 
445 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.72 
 
 
365 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.02 
 
 
386 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  30.67 
 
 
506 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  27.16 
 
 
395 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  30.15 
 
 
442 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.3 
 
 
370 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  27.97 
 
 
656 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  30.98 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.08 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  28.53 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.72 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.61 
 
 
407 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  27.3 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  27.19 
 
 
409 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  31.56 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.19 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.38 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.88 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.66 
 
 
385 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.38 
 
 
391 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.8 
 
 
378 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  28.62 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.34 
 
 
376 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  30.18 
 
 
402 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.89 
 
 
443 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>