More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5323 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  90.26 
 
 		 422 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  97.15 
 
 		 402 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  857    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  66.5 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  43.6 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  41.31 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  38.78 
 
 		 477 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  37.41 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  37.44 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  37.78 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.2 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  37.05 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.48 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.54 
 
 		 390 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  37.13 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.14 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  37.13 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.42 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.33 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.24 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  31.5 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  32.2 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.09 
 
 		 325 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  32.05 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.78 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.78 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  29.58 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.02 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 435 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  32.67 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  30.85 
 
 		 503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.53 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.22 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.67 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.24 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  35.08 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.38 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.5 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.55 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.54 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  31.25 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.66 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.61 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.24 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.43 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  30.68 
 
 		 656 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  29.3 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.54 
 
 		 357 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  28.44 
 
 		 507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.07 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.19 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.47 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.98 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  28.78 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.27 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  35.34 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  35.34 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.51 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.46 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.1 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.04 
 
 		 506 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.53 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.2 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.81 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  26.43 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.04 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.86 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.86 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  33.75 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.76 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.68 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  28.69 
 
 		 447 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.66 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  27.99 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.78 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 465 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.06 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  27.47 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  27.47 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  35.39 
 
 		 201 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.87 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.12 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  27.11 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  29.12 
 
 		 308 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.23 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.19 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  28.62 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.8 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>