More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0820 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  100 
 
 
378 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  32.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.91 
 
 
392 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.28 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.23 
 
 
374 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.23 
 
 
374 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.43 
 
 
389 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.7 
 
 
373 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.25 
 
 
414 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.11 
 
 
369 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.75 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.71 
 
 
477 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.83 
 
 
369 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  30.4 
 
 
369 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.89 
 
 
392 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.62 
 
 
387 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  33.66 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  29.23 
 
 
388 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.3 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.54 
 
 
416 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.25 
 
 
363 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.25 
 
 
325 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.71 
 
 
404 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.52 
 
 
383 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.73 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.07 
 
 
381 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.33 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.65 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.99 
 
 
370 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.1 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.45 
 
 
378 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.87 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.55 
 
 
391 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.79 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.35 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.61 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.85 
 
 
377 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.55 
 
 
365 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.21 
 
 
357 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.11 
 
 
431 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.24 
 
 
367 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  24.48 
 
 
426 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  26.48 
 
 
487 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  25 
 
 
463 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.87 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.16 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.45 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.32 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.15 
 
 
371 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.98 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  29.32 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.93 
 
 
378 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  23.37 
 
 
507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.18 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.39 
 
 
381 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.08 
 
 
381 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.92 
 
 
379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.92 
 
 
379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.01 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.47 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.56 
 
 
442 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.56 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.88 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.35 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.37 
 
 
376 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.3 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.3 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.81 
 
 
422 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.2 
 
 
376 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  22.58 
 
 
387 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.11 
 
 
370 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24 
 
 
402 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.71 
 
 
376 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.48 
 
 
393 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.33 
 
 
409 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.7 
 
 
374 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  21.04 
 
 
406 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.79 
 
 
384 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  24.12 
 
 
656 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  22.85 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.27 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  26.78 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.68 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.92 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.12 
 
 
451 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.82 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.12 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  29.12 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.41 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.41 
 
 
260 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  23.77 
 
 
422 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  23.46 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  24.4 
 
 
395 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.35 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.33 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.08 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.52 
 
 
402 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.2 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.03 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.77 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>