More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1966 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  100 
 
 
403 aa  810    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  43.78 
 
 
409 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.58 
 
 
369 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.08 
 
 
369 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.22 
 
 
374 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.22 
 
 
374 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.82 
 
 
369 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.81 
 
 
414 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  31.95 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.2 
 
 
370 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  30.95 
 
 
381 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.06 
 
 
390 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.81 
 
 
391 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  31.12 
 
 
392 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.84 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.41 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.52 
 
 
435 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  32.11 
 
 
383 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  33.33 
 
 
416 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.32 
 
 
385 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.49 
 
 
379 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.57 
 
 
389 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  28.43 
 
 
463 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.35 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.2 
 
 
363 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.93 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  30.79 
 
 
378 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  32.84 
 
 
487 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  28.86 
 
 
508 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  28.86 
 
 
508 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.28 
 
 
325 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2947  DNA integration/recombination/invertion protein  44.79 
 
 
177 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.25 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.75 
 
 
377 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.25 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.41 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  42.51 
 
 
201 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.04 
 
 
392 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.05 
 
 
305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.42 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.1 
 
 
378 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30.34 
 
 
477 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.77 
 
 
383 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  31.31 
 
 
374 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30.33 
 
 
404 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.21 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.51 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.29 
 
 
391 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.55 
 
 
381 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.3 
 
 
381 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  29.63 
 
 
376 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.13 
 
 
391 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.13 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.01 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  27.3 
 
 
413 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  28.37 
 
 
494 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  30.03 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.18 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  29.83 
 
 
377 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.85 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.85 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.97 
 
 
431 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.45 
 
 
376 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  33.45 
 
 
471 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  33.45 
 
 
471 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.17 
 
 
367 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.1 
 
 
370 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.34 
 
 
426 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.57 
 
 
422 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.05 
 
 
371 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.01 
 
 
357 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.41 
 
 
376 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.65 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.65 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.01 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.19 
 
 
402 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.08 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.99 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  32.11 
 
 
465 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  34.29 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.82 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  20.76 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.86 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  26.95 
 
 
399 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.62 
 
 
451 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.8 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  30.49 
 
 
209 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.63 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.21 
 
 
407 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.71 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  33.99 
 
 
460 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.73 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  26.76 
 
 
422 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.5 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.14 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.6 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.32 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.89 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  23.81 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>