More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0476 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  100 
 
 		 371 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  41.31 
 
 		 422 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  40.55 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  39.9 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  41.29 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  41.71 
 
 		 477 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  38.01 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  32.8 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  29.38 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  35.81 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  37.57 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  37.57 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  33.33 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  32.66 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  35.93 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.87 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.23 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33.58 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  34.14 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  31.66 
 
 		 416 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  32.05 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.23 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.13 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.81 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.31 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  35.62 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  33.83 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  30.2 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.95 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.92 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.41 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.17 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.37 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.66 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.27 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.64 
 
 		 506 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.31 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.03 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  31.14 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.63 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  29.58 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.32 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.77 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  31.37 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.68 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.61 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  26.9 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.56 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.05 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  34.91 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  34.91 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 407 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.27 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.48 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.69 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.37 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.36 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  31.12 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.58 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.82 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.69 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  28.16 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0597  integrase family protein  26.45 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.93 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  27.6 
 
 		 656 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  32.3 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.1 
 
 		 442 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  31.36 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.24 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.96 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.79 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.27 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.4 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  26.53 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.81 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  28.81 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  23.27 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.82 
 
 		 494 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30.39 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.57 
 
 		 301 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.84 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.84 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  24.93 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  24.65 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  29.08 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.96 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.82 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.07 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>