More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6718 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  100 
 
 		 656 aa  1326    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  75.1 
 
 		 494 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  41.83 
 
 		 492 aa  342  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  38 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  43.82 
 
 		 377 aa  265  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  32.85 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  32.85 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  32.7 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.81 
 
 		 387 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.02 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.27 
 
 		 404 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.39 
 
 		 377 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.86 
 
 		 414 aa  157  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  28.45 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.32 
 
 		 369 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.68 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.75 
 
 		 389 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  31.14 
 
 		 377 aa  144  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.04 
 
 		 369 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.23 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.77 
 
 		 374 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.77 
 
 		 374 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.15 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.72 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.37 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 388 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  31.27 
 
 		 431 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.9 
 
 		 325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.67 
 
 		 370 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 391 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.6 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.91 
 
 		 363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.68 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.82 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.61 
 
 		 392 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 403 aa  128  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.94 
 
 		 402 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.06 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  29.2 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.79 
 
 		 422 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.45 
 
 		 383 aa  124  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.84 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.46 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  35.62 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.68 
 
 		 378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.59 
 
 		 391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  35.62 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.54 
 
 		 437 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.68 
 
 		 373 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.69 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.6 
 
 		 371 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.45 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  35.15 
 
 		 337 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.8 
 
 		 443 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.49 
 
 		 374 aa  108  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 368 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.45 
 
 		 409 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.12 
 
 		 378 aa  107  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.88 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.91 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.07 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.67 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  35.78 
 
 		 429 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.62 
 
 		 398 aa  99.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.13 
 
 		 406 aa  98.2  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.36 
 
 		 391 aa  96.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 386 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 367 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 384 aa  94.7  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.15 
 
 		 357 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28.65 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.73 
 
 		 413 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.19 
 
 		 393 aa  91.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.18 
 
 		 388 aa  91.3  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.73 
 
 		 370 aa  90.5  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.8 
 
 		 365 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  25.89 
 
 		 407 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 465 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  30.77 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  23.19 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.29 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.44 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  22.83 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.01 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.81 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 121 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.56 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.56 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  19.73 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4338  phage integrase  67.95 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857538  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  22.73 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  20.63 
 
 		 409 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  31.96 
 
 		 201 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.38 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0388  hypothetical protein  46.49 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.04 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>