102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3454 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  41.64 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  31.47 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  36.82 
 
 		 508 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  36.82 
 
 		 508 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  32.02 
 
 		 656 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  35.51 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.54 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  39.27 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  35.35 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.29 
 
 		 414 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.42 
 
 		 463 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.43 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.48 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.87 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  34.27 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.98 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.98 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.85 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.3 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.23 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  34.83 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.04 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  32.18 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.29 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.77 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.24 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.3 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.83 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.1 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.59 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.99 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.07 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.48 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2947  DNA integration/recombination/invertion protein  33.58 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.74 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.4 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.21 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.44 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.27 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.94 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.21 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.62 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  21.74 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.27 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  24.55 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.77 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.29 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4338  phage integrase  52.38 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857538  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  32.69 
 
 		 507 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.17 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.92 
 
 		 431 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.84 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.69 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  34.31 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  23.39 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.59 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  31.03 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1616  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1641  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.931183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1587  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.806323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.41 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.62 
 
 		 477 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  28.1 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.43 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.21 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.4 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  19.25 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.7 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.7 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.76 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  23.16 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.7 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.21 
 
 		 442 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  31.63 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.16 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  32.64 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  24.41 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.9 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  34.65 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  46.15 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.42 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  21.66 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  21.66 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.46 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3189  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000104193  normal  0.041217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>