More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3691 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  100 
 
 
370 aa  767    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  38.17 
 
 
389 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  34.96 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  36.31 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  37.7 
 
 
383 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  36.08 
 
 
381 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  33.76 
 
 
435 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.92 
 
 
385 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  35.35 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  31.25 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  33.86 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  33.43 
 
 
370 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.18 
 
 
392 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.59 
 
 
374 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.59 
 
 
374 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.61 
 
 
413 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.79 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  32.38 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  31.44 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.61 
 
 
370 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.99 
 
 
414 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.53 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.86 
 
 
388 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.67 
 
 
477 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.27 
 
 
392 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.38 
 
 
400 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.55 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.55 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  32.08 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.53 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.28 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.88 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.45 
 
 
376 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.63 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.12 
 
 
378 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.17 
 
 
305 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.45 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.66 
 
 
463 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.23 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.62 
 
 
377 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.42 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.27 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.53 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  26.09 
 
 
487 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.17 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.16 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.75 
 
 
416 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.1 
 
 
391 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.27 
 
 
422 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.07 
 
 
384 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.33 
 
 
431 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.37 
 
 
404 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.51 
 
 
379 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.51 
 
 
379 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.39 
 
 
377 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.36 
 
 
371 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  23.38 
 
 
442 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.22 
 
 
357 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.77 
 
 
471 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.92 
 
 
403 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.15 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.18 
 
 
386 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.77 
 
 
471 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.07 
 
 
451 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.5 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  21.56 
 
 
443 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.21 
 
 
443 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.38 
 
 
381 aa  93.2  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.85 
 
 
506 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  22.44 
 
 
393 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  25.08 
 
 
656 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.29 
 
 
416 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.5 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.99 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  22.73 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.73 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.63 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.03 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  25.45 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  21.43 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.08 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  24.66 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.74 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  23.38 
 
 
494 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.68 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.34 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.82 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  29.02 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  24.74 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  30.04 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.67 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.51 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.11 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.47 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  23.01 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.2 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.2 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2947  DNA integration/recombination/invertion protein  27.66 
 
 
177 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>