More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0860 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  100 
 
 
370 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  51.64 
 
 
365 aa  319  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  49.39 
 
 
397 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  44.51 
 
 
407 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  48.41 
 
 
367 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  41.67 
 
 
433 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  41.67 
 
 
424 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  40.43 
 
 
402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  42.19 
 
 
399 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  40.11 
 
 
390 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  32.76 
 
 
394 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  33.7 
 
 
368 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  33.33 
 
 
361 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  32.63 
 
 
395 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  30.19 
 
 
373 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  31.27 
 
 
391 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  36.01 
 
 
377 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.84 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.47 
 
 
390 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  31.74 
 
 
370 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  34.17 
 
 
451 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  31.23 
 
 
383 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.3 
 
 
400 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  29.75 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  30.48 
 
 
451 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.96 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  31.46 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  29.61 
 
 
387 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.09 
 
 
363 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  43.37 
 
 
182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.08 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.21 
 
 
395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.73 
 
 
477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.16 
 
 
379 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.3 
 
 
383 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.96 
 
 
379 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.96 
 
 
379 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.67 
 
 
374 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.67 
 
 
374 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.55 
 
 
368 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.06 
 
 
389 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.64 
 
 
370 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.38 
 
 
385 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.39 
 
 
396 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 
435 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.63 
 
 
369 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.9 
 
 
454 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.5 
 
 
325 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.31 
 
 
391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  30.27 
 
 
388 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  50.43 
 
 
151 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.63 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.01 
 
 
378 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  31.16 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.04 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.62 
 
 
383 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.5 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.4 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.37 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.57 
 
 
377 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.39 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.72 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.16 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.76 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.33 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.68 
 
 
404 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.16 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.03 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  27.73 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.16 
 
 
443 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.59 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  27.53 
 
 
453 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.59 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  31.03 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  26.94 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.05 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.1 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  28.96 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.98 
 
 
391 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.6 
 
 
451 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.77 
 
 
305 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.43 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.59 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.78 
 
 
380 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.11 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  30 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.14 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.62 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.35 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.51 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  29.81 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.1 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.74 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.12 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.61 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  25.47 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.1 
 
 
401 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  25.27 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.67 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>