More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2293 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  100 
 
 		 395 aa  810    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  51.9 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  45.19 
 
 		 422 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  41.3 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  33.18 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  31.51 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.05 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.46 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.84 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.78 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.84 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.46 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  29 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.41 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.03 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28.65 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.45 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.51 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.45 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.27 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.51 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.8 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.48 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.3 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.27 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.96 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.86 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3352  hypothetical protein  69.84 
 
 		 83 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.09 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.09 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  25.84 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.09 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.52 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.3 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.34 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.14 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.45 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.95 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.06 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.19 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.46 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.13 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.03 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.18 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.64 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.08 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  28.76 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.78 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.68 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  24.83 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  26.85 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.88 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.33 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.99 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.28 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.28 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.79 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.16 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.26 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  24.24 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.22 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.14 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.71 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.5 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.5 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.44 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.77 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.16 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  22.29 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.5 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.53 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.37 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  21.97 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.78 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.85 
 
 		 260 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.12 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.83 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.99 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  21.99 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.84 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>