More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5370 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  100 
 
 		 498 aa  1040    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  43.71 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  42.63 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  38.35 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 184 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  52.56 
 
 		 198 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.59 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.62 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  29.3 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.96 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  28.99 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  23.22 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.7 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.34 
 
 		 365 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  23.08 
 
 		 451 aa  67  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.07 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  52.63 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  25.2 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  50.91 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.06 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  52.63 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  47.89 
 
 		 332 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  23.9 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  49.3 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.94 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.7 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.7 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.29 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.52 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  44.93 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  49.3 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  42.47 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.23 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.06 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.16 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  25 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.29 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.29 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  41.27 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  37 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  39.22 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  42.5 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  50.88 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  40.91 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  37.08 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  48.21 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  46.67 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.44 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  23.76 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  46.48 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  45.16 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.97 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.09 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  43.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  43.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.65 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  41.76 
 
 		 312 aa  57  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  46.67 
 
 		 302 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  41.43 
 
 		 311 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  45.28 
 
 		 315 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  46.67 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  46.67 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.73 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  34.62 
 
 		 273 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  46.43 
 
 		 328 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  25.08 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.98 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  42.37 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  39.13 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  39.13 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.08 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  47.17 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  43.33 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  47.17 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  47.17 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  43.55 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.29 
 
 		 386 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  44.07 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  38.32 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  46.55 
 
 		 311 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  43.4 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  47.27 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  43.33 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  45.71 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>