More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0067 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  100 
 
 		 328 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  49.66 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  45.42 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  46 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  46.79 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  46.15 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  46.2 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  43.96 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  44.19 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  40.46 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  45 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  45.3 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  42.68 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  42.62 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  44.97 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  40.74 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.95 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 301 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  39.78 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.47 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.74 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  40.26 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  43.89 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  38 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.87 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.46 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.87 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.67 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  39.8 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  38.26 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.43 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.13 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  41.4 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  38.89 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.33 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  40.25 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  40.72 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.33 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  36.91 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  36.62 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.42 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  42.02 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.69 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  36.27 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.33 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  38.13 
 
 		 296 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  39.6 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.31 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  42.42 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  38.05 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  41.97 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  39.2 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  41.23 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  41.08 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  39.41 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  40.33 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  38.74 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  37.13 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  38.72 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.27 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  37.91 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  38.72 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.27 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.13 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  39.05 
 
 		 317 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  34.24 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  40.07 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  39.47 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.22 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  39.39 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  41.39 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  35.43 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  35.62 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  38.1 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  38.11 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  40.73 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  36.96 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.57 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  36.96 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.24 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  36.03 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  35.91 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  38.93 
 
 		 297 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  34.88 
 
 		 302 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  36.91 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.47 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>