More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2788 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  98.54 
 
 
343 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
343 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  94.46 
 
 
342 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  78.78 
 
 
311 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  51.67 
 
 
293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  48.36 
 
 
294 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  50.66 
 
 
302 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  50.16 
 
 
332 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  51 
 
 
293 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  46.53 
 
 
298 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  46.53 
 
 
307 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  46.53 
 
 
307 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  46.73 
 
 
307 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  50.83 
 
 
294 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  51.94 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  46.67 
 
 
298 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.26 
 
 
298 aa  245  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  48.51 
 
 
294 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.26 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  44.26 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  49.04 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.93 
 
 
298 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  46.35 
 
 
317 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.07 
 
 
300 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.07 
 
 
300 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.51 
 
 
300 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.51 
 
 
300 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.07 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.67 
 
 
299 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  49 
 
 
304 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.93 
 
 
302 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  46.08 
 
 
324 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  48.03 
 
 
313 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  48.8 
 
 
294 aa  235  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  44.37 
 
 
290 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  40.58 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.92 
 
 
296 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  43.14 
 
 
296 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  41.33 
 
 
305 aa  232  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
299 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
299 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  46.69 
 
 
297 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  42.71 
 
 
302 aa  229  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
299 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
299 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.85 
 
 
295 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  41.06 
 
 
297 aa  228  8e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.19 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.59 
 
 
303 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.47 
 
 
291 aa  228  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.59 
 
 
303 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.59 
 
 
303 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
296 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  44.69 
 
 
309 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.37 
 
 
300 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.48 
 
 
311 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.19 
 
 
299 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  46.82 
 
 
302 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  43.14 
 
 
295 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.85 
 
 
298 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 
299 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  47.54 
 
 
304 aa  225  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  44.11 
 
 
299 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  43.33 
 
 
302 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 
299 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
299 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  45.7 
 
 
300 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.31 
 
 
301 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.42 
 
 
299 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  44.44 
 
 
335 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
295 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  39.54 
 
 
304 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  40.32 
 
 
310 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  42.09 
 
 
291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  44.95 
 
 
328 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  45.95 
 
 
299 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.72 
 
 
299 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.15 
 
 
296 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.45 
 
 
299 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.86 
 
 
299 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  44.84 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.44 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>