More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0492 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  81.91 
 
 		 294 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  69.73 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  69.62 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  68.6 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  62.89 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  56.86 
 
 		 332 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  57.81 
 
 		 317 aa  322  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  51.19 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  51.34 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  50.67 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  50.34 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  50.68 
 
 		 343 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  45.64 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  44.52 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  44.9 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  47.12 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  43.3 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  45.05 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  42.09 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  44.3 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  40.88 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  45.3 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  44.44 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  41.08 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  44.85 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  42.49 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  43.48 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.78 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  42.12 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.47 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.47 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.48 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  44.56 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.59 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.84 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.78 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  41.53 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.78 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  40.59 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.15 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  43.28 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.6 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.85 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  42.07 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  38.64 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.14 
 
 		 299 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  38.72 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.14 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  44.77 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  40.48 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.14 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  40.4 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  38.82 
 
 		 373 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  42.57 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  43.15 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  38.13 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  42.35 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  40.26 
 
 		 335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  40.34 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  43.96 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  43.14 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  42.09 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  38.1 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.4 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  40.21 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  40.21 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.4 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.55 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.72 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>