More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1383 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  46.8 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  46.96 
 
 
313 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.46 
 
 
299 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 
298 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  45.33 
 
 
295 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  45 
 
 
296 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  45 
 
 
296 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
296 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.67 
 
 
296 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  45.67 
 
 
293 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  45.33 
 
 
293 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  44.59 
 
 
301 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  46.23 
 
 
290 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  43.2 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  45.72 
 
 
294 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  44.67 
 
 
307 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  45 
 
 
307 aa  249  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  44.19 
 
 
294 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  44.85 
 
 
304 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  45 
 
 
307 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.73 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.81 
 
 
297 aa  243  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  44.11 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  43.04 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  42.67 
 
 
296 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  44.83 
 
 
302 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  43.75 
 
 
332 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  41.86 
 
 
294 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 
299 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 
299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  45.67 
 
 
298 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.67 
 
 
302 aa  235  8e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  41.67 
 
 
300 aa  235  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.67 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
299 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
299 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.71 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
300 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  41.47 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.19 
 
 
342 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 
301 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  42.05 
 
 
296 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.68 
 
 
317 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  39 
 
 
295 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  39 
 
 
295 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  40.26 
 
 
302 aa  227  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.14 
 
 
295 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 
295 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  40.48 
 
 
299 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 
303 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
300 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.33 
 
 
302 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.86 
 
 
294 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  40.41 
 
 
291 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.52 
 
 
302 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  41.78 
 
 
300 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  41.61 
 
 
296 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  41.1 
 
 
301 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 
305 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.98 
 
 
300 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 
298 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 
292 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  41.64 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  42.18 
 
 
308 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  39.33 
 
 
296 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  41.36 
 
 
302 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 
343 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 
343 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
297 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  41.61 
 
 
299 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.41 
 
 
298 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  40.41 
 
 
298 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.41 
 
 
298 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 
298 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
300 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  40.82 
 
 
305 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
300 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  40.27 
 
 
304 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  38.7 
 
 
310 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  40.07 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>