More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1473 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  45.95 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.97 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.96 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  46.1 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.9 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.63 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.63 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.97 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.97 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  43.58 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  43.05 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  43.89 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  45.58 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  43.23 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  44.03 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  41.41 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  43.92 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  41.02 
 
 		 306 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.84 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  43.71 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 298 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  43.24 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  43.27 
 
 		 277 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  41.61 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.28 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  42.32 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  42.12 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  42.57 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  41.67 
 
 		 298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  40.47 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.58 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  40.88 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  42 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.34 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.75 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.03 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  40.55 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  40.65 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  41.47 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.97 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  43.34 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.69 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  38.49 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  38.49 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.79 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  39.66 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  43.4 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  41.61 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>