More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3654 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
301 aa  621  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.66 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.66 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.32 
 
 
299 aa  597  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.66 
 
 
299 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.66 
 
 
299 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.32 
 
 
299 aa  597  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  96.66 
 
 
299 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  95.65 
 
 
299 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  95.65 
 
 
299 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  92.98 
 
 
299 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.4 
 
 
300 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.41 
 
 
300 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  47.28 
 
 
300 aa  280  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  46.96 
 
 
296 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  47.49 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  46.74 
 
 
298 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  46.74 
 
 
298 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 
299 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  45.57 
 
 
298 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  46.71 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  42.41 
 
 
290 aa  258  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  46.44 
 
 
307 aa  258  9e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
298 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
296 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.74 
 
 
295 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  40.14 
 
 
294 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  43.79 
 
 
307 aa  246  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 
296 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  44.14 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.84 
 
 
296 aa  245  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.84 
 
 
296 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  43.79 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  43.09 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  42.32 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  41.92 
 
 
296 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  43.64 
 
 
297 aa  241  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  42.05 
 
 
306 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  41.47 
 
 
294 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  40.61 
 
 
295 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.33 
 
 
293 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  43.62 
 
 
298 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  42.81 
 
 
293 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  42.12 
 
 
317 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39.32 
 
 
295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  41.2 
 
 
294 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  42.14 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  39.32 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  41.2 
 
 
304 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
297 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 
320 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  39.12 
 
 
296 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  38.57 
 
 
295 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
311 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  41.02 
 
 
311 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  39.06 
 
 
302 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  42.47 
 
 
294 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  38.57 
 
 
295 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 
292 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  41.69 
 
 
299 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  39.06 
 
 
303 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 
313 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  40.94 
 
 
302 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 
342 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
318 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  39.25 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 
292 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.46 
 
 
314 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.34 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  41.64 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  38.62 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 
306 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  41.61 
 
 
294 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  41.06 
 
 
343 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  38.44 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  36.81 
 
 
308 aa  219  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
317 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  38.64 
 
 
302 aa  219  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 
315 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  40.73 
 
 
343 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 
318 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.46 
 
 
302 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 
294 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 
318 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  37.76 
 
 
295 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 
318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>