More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1201 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  75.74 
 
 		 313 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  69.03 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  68.49 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  67.41 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  64.35 
 
 		 317 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  64.19 
 
 		 311 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.86 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.86 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.55 
 
 		 318 aa  361  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  65.62 
 
 		 345 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  63.09 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  62.38 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  63.69 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  64.31 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  64.13 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  63.41 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  63.29 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  61.83 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  61.61 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  64.5 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  65.03 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  57.64 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  58.79 
 
 		 306 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  57.47 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  60.47 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  62.03 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  60.88 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  64.63 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  62.62 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  56.31 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 443 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  55.42 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  58.23 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  56.96 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.3 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.91 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.26 
 
 		 296 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.61 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.94 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.88 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.31 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  44.09 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  46.05 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  46.5 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  42.81 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  41.8 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.7 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  45.21 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  41.8 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  42.95 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  42.63 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  46.15 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  42.95 
 
 		 302 aa  228  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.98 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  38.85 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.24 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  41.83 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  38.92 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  45.21 
 
 		 295 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  43.29 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  42.24 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  44.12 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.62 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  51.86 
 
 		 316 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44.74 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.74 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  38.1 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  45.63 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  41.08 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  41.59 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.09 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.34 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.1 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.48 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.78 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.53 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.69 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>