More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1241 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 311 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  66.56 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  64.94 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  64.19 
 
 		 321 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  64.69 
 
 		 311 aa  358  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.31 
 
 		 317 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.07 
 
 		 314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  62.21 
 
 		 346 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  62.34 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  62.34 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  62.34 
 
 		 318 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  61.49 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  61.02 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  64.63 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  60 
 
 		 324 aa  340  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.14 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  63.16 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  63.82 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  61.76 
 
 		 321 aa  331  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  59 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  58.86 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  65.38 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  57.7 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  60.43 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  57.95 
 
 		 301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  58.73 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  62.87 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  60.53 
 
 		 314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  62.05 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  58.73 
 
 		 443 aa  299  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  60.66 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  53.92 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  49.84 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  60.76 
 
 		 383 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  58.52 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  54.81 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.67 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  46.43 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  48.15 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  47.51 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.64 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45.48 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  43.71 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  43.89 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  49.17 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  46.36 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  49.17 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  43.56 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  43.97 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  41.56 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  45.15 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  40.2 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  46.15 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.45 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.87 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.93 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  44.59 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  45.15 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  44.48 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  38.96 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  44.52 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  40.79 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  47.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.19 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  38.74 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.67 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  44.16 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.69 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.69 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.72 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  40.92 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>