More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  100 
 
 
332 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  60 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.89 
 
 
318 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.89 
 
 
318 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.68 
 
 
317 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.89 
 
 
318 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  57.4 
 
 
324 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.29 
 
 
311 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  56.77 
 
 
317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  58.65 
 
 
311 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  52.99 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 
362 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  56.78 
 
 
318 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.42 
 
 
321 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  56.77 
 
 
310 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  55.38 
 
 
331 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.01 
 
 
345 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  54.81 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  58.33 
 
 
299 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  55.52 
 
 
313 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.27 
 
 
325 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  53.65 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  59.62 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  54.46 
 
 
313 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  54.95 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  53.02 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  54.26 
 
 
321 aa  266  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  53.16 
 
 
306 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  55.31 
 
 
328 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  54.41 
 
 
353 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  55.42 
 
 
344 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  49.2 
 
 
301 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  48.58 
 
 
443 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.04 
 
 
299 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  42.36 
 
 
308 aa  230  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 
319 aa  229  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.05 
 
 
302 aa  228  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.9 
 
 
298 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.34 
 
 
296 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  43.99 
 
 
302 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  49.84 
 
 
314 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.29 
 
 
295 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.56 
 
 
295 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  40.67 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 
296 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.01 
 
 
296 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  39.03 
 
 
295 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  39.03 
 
 
295 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  52.98 
 
 
383 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 
296 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  40.89 
 
 
320 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  44.55 
 
 
293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  40.19 
 
 
294 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 
299 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.48 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  40.51 
 
 
297 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  39.94 
 
 
295 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.35 
 
 
297 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  45.37 
 
 
293 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.31 
 
 
317 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  40.91 
 
 
292 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
299 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  41.42 
 
 
295 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.97 
 
 
299 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.87 
 
 
302 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  49.2 
 
 
316 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  40.78 
 
 
295 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  43.93 
 
 
295 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 
296 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  34.52 
 
 
296 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.03 
 
 
305 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 
298 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  37.34 
 
 
299 aa  205  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  37.85 
 
 
305 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 
299 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.94 
 
 
297 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.26 
 
 
302 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  42.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.74 
 
 
302 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.77 
 
 
294 aa  203  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  43.61 
 
 
314 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>