More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1060 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 295 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  85.08 
 
 		 295 aa  534  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  85.08 
 
 		 295 aa  534  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.77 
 
 		 296 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.77 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.77 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.7 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.46 
 
 		 299 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  51.19 
 
 		 295 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  48.99 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  47.8 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  48.81 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  48.99 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  46.28 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  45.08 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  47.42 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  47.12 
 
 		 297 aa  290  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  45.76 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  48.15 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  45.42 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45.42 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.58 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  45.42 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  45.76 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.9 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  45.08 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.56 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.58 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  45.08 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  44.75 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  44.56 
 
 		 305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 298 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  44.07 
 
 		 314 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  44.75 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  43.3 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45.64 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  44.52 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  44.22 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.2 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.37 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  43.84 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  43.1 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  45.58 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  43.42 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  43.52 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  43.42 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  43.92 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  43.2 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 277 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.88 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  44.07 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  44.07 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  42.56 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  42.41 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  43.39 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.38 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  40.55 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  40.55 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  43.15 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.41 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  41.33 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  43.3 
 
 		 305 aa  254  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.41 
 
 		 333 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>