More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1099 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 296 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  63.85 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  59.12 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  57.43 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  55.41 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 296 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 296 aa  348  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 296 aa  348  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 296 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.57 
 
 		 296 aa  348  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  55.41 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.23 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.23 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.71 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.05 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.89 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.89 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.89 
 
 		 296 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.89 
 
 		 296 aa  343  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  53.04 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  52.19 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  48.99 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  49.83 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  49.66 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  47.97 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  47.97 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  49.48 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  49.15 
 
 		 291 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  48.97 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  47.64 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  46.98 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  46.64 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  47.97 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  46.46 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  46.64 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  46.94 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  48.65 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  46.6 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  47.14 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  46.96 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  47.46 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.1 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  47.64 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  47.64 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  48.31 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  47.64 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.76 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  45.89 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  45.89 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.1 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  44.93 
 
 		 302 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  43.58 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  45.95 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  45.36 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  42.45 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.86 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  44.93 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  45.76 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  44.26 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  44.93 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  44.26 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  44.86 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  44.86 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  43.92 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  45.21 
 
 		 304 aa  255  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  42.19 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  44.82 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  46.29 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  45.27 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.71 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.84 
 
 		 298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  44 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  42.47 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  43.79 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  44.3 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  43.84 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  44.18 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  44.18 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  46.32 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  47.84 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  43.25 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  42.57 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  43.33 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2258  tyrosine recombinase XerD  47.3 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  44.18 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  44.18 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  46.13 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  43.84 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.86 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  45.05 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  44.56 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  43.58 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>