More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1827 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  72.7 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  67.11 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  63.4 
 
 		 306 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  64.8 
 
 		 305 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  61.18 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  60.86 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.44 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  43.33 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  43.39 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.13 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.79 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  42.91 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  44.9 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  44.9 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  42.11 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  41.67 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  45.08 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  46.26 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  43.85 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  44.59 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  45.08 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  41.39 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  41.97 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  43.54 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  41.14 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.21 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.78 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  41.06 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  45.02 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45.24 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  40.73 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  43.54 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  43.33 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.47 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  43.2 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  42.27 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  44.07 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  44.41 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  41.9 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  42.66 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 298 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  43.28 
 
 		 310 aa  238  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  40.66 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  39.18 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  42.57 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  43.05 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  40.48 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.96 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  40.26 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  38.46 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  41 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  41.86 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  40.58 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.46 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  39.55 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  39.54 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  40.78 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  41.03 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  39.93 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  41.2 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  42.62 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>